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　　abi3130基因測序儀采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳，應用四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法)，因此通過單引物pcr測序反應，DNA測序儀生成的pcr產物則是相差1個堿基的3末端為4種不同熒光染料的單鏈dna混合物，使得四種熒光染料的測序。
 

　　pcr產物可在一根毛細管內電泳，從而避免了泳道間遷移率差異的影響，大大提高了測序的精確度。
 

　　由于分子大小不同，在毛細管電泳中的遷移率也不同，當其通過毛細管讀數窗口段時，激光檢測器窗口中的ccd(charge-coupleddevice)攝影機檢測器就可對熒光分子逐個進行檢測，激發的熒光經光柵分光，以區分代表不同堿基信息的不同顏色的熒光，并在ccd攝影機上同步成像，分析軟件可自動將不同熒光轉變為dna序列，從而達到dna測序的目的。
 

　　分析結果能以凝膠電泳圖譜、熒光吸收峰圖或堿基排列順序等多種形式輸出。
 

　　它是一臺能自動灌膠、自動進樣、自動數據收集分析等全自動電腦控制的測定dna片段的堿基順序或大小和定量的高檔精密儀器。還提供凝膠高分子聚合物，包括dna測序膠(pop6)和genescan膠(pop4)。
 

　　這些凝膠顆粒孔徑均一，避免了配膠條件不一致對測序精度的影響。它主要由毛細管電泳裝置、macintosh電腦、彩色打印機和電泳等附件組成。
 

　　電腦中則包括資料收集，分析和儀器運行等軟件。它使用新的ccd攝影機檢測器，使dna測序縮短至2.5h，pcr片段大小分析和定量分析為10~40min。
 

　　由于該儀器具有dna測序，pcr片段大小分析和定量分析等功能，因此可進行dna測序、雜合子分析、單鏈構象多態性分析、微衛星序列分析、長片段pcr、rt-pcr(定量pcr)等分析，臨床上可除進行常規dna測序外，還可進行單核苷酸多態性分析、基因突變檢測、hla配型、法醫學上的親子和個體鑒定、微生物與病毒的分型與鑒定等。